理疗师发证机关是指负责发放理疗师职业资格证书的官方机构，理疗师的职业资格认证是由国家卫生健康委员会（原卫生部）和人力资源和社会保障部共同负责的。

1、国家卫生健康委员会：国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门之一，主要负责全国卫生和计划生育工作，包括医疗、预防、保健等方面，该部门下设多个司局，其中包括负责医疗卫生行业管理的司局，在医疗卫生行业管理方面，国家卫生健康委员会负责制定和实施相关政策、规划和标准，对医疗机构进行监管和指导，以及开展相关培训和考试等工作，可以认为国家卫生健康委员会是负责理疗师发证机关的一部分。

2、人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部是中华人民共和国国务院组成部门之一，主要负责全国就业、社会保障、人事人才等方面的工作，该部门下设多个司局，其中包括负责职业资格认证工作的司局，在职业资格认证方面，人力资源和社会保障部负责制定和实施相关政策、规划和标准，对职业技能培训机构进行监管和指导，以及开展相关培训和考试等工作，可以认为人力资源和社会保障部也是负责理疗师发证机关的一部分。

3、地方卫生健康委员会：地方卫生健康委员会是各地方政府设立的专门负责本行政区域内医疗卫生工作的部门，在地方层面，地方卫生健康委员会也承担着部分与理疗师发证相关的工作，地方卫生健康委员会可能会组织或参与理疗师职业资格认证的相关工作，或者对本行政区域内的医疗机构进行监督和管理。

4、地方人力资源和社会保障局：地方人力资源和社会保障局是地方政府设立的专门负责本行政区域内人力资源和社会保障工作的部门，在地方层面，地方人力资源和社会保障局也可能承担一部分与理疗师发证相关的工作，例如对职业技能培训机构进行监管和指导，或者开展相关培训和考试等工作。

理疗师发证机关主要包括国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部以及地方卫生健康委员会和地方人力资源和社会保障局，这些机构在各自职责范围内负责理疗师职业资格认证的相关工作，确保从业人员具备相应的专业能力和素质。