中医康复理疗师证书的发证机关是中国国家卫生健康委员会（National Health Commission of the People's Republic of China, NHPC）。

中国国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门之一，负责全国医疗卫生行政管理工作，包括医疗机构管理、公共卫生服务、疾病预防控制、卫生监督等职能，在中医领域，国家卫生健康委员会承担着制定和实施中医药政策、标准、规范以及监管中医医疗服务质量的责任。

中医康复理疗师证书的发放流程通常包括以下几个步骤：

1、报名：有意向从事中医康复理疗工作的人员需要先进行报名，这通常可以通过国家卫生健康委员会的官方网站或者指定的机构进行。

2、培训与考核：完成报名后，申请者需要接受相关的中医理论及技术培训，并通过国家卫生健康委员会组织的考核，考核内容可能包括理论知识测试、实践技能操作等。

3、审核：培训合格后，申请者需要提交个人资料、培训证明等相关材料，由国家卫生健康委员会进行审核确认。

4、颁发证书：审核通过后，国家卫生健康委员会将颁发中医康复理疗师证书，并可能要求申请者在一定期限内注册执业。

中医康复理疗师证书的含金量较高，因为它代表了持有者具备一定的中医康复理疗专业知识、技能和实践经验，拥有此证书的康复理疗师可以独立开展中医康复理疗业务，为患者提供专业的治疗服务，随着中国对中医药的重视程度不断提升，中医康复理疗师证书也成为了从业人员提升自己专业水平的一种方式。

需要注意的是，由于国家卫生健康委员会的职能可能会有所调整，具体的发证机关可能会有所变化，如果您需要了解最新的发证机关信息，建议直接咨询国家卫生健康委员会或其官方网站。